После отказа передать дело для рассмотрения в Тверской суд Москвы, Басманный суд Москвы перешел к рассмотрению дела по существу.
Согласно обвинительному заключению, Мельконьянц обвиняется в организации на территории РФ деятельности признанной нежелательной «Европейской сети организаций по наблюдению за выборами» (ENEMO). По данным прокуратуры, ее структурным членом была ассоциация «В защиту прав избирателей «Голос», которая просуществовала с 2000 по 2016 год и активным участником которой был Мельконьянц. С 2013 года Мельконьянц стал также сопредседателем незарегистрированного движения «Голос», которое продолжило свою работу после ликвидации ассоциации.
27 сентября 2021 года Генпрокуратура признала «ENEMO» нежелательной организацией и запретила ее деятельность на территории России. Суды расценили продолжение деятельности «Голоса» как участие в деятельности нежелательной организации.
Один из эпизодов, который вменяется в вину Мельконьянцу — выступление на круглом столе ЦИК России по вопросам проведения электронного голосования на выборах 11 сентября 2022 года. Прокуратура считает, что раз Мельконьянц не направил запрос о ликвидации движения «Голос», то он тем самым «полностью реализовал свой преступный умысел».
Григорий Мельконьянц заявил, что ему непонятно обвинение и вину он не признает. Он назвал неправомерным проставление знака равенства между ассоциацией и движением «Голос».
Адвокат Михаил Бирюков поддержал позицию Мельконьянца, заявив, что обвинение основано на ложных предположениях. Он также указал на то, что следствие называет «Голос» одновременно и членом и структурным подразделением «ENEMO».
В тринадцати томах дела были перечислены многочисленные свидетельства участия Мельконьянца в движении «Голос», личные характеристики позиции государственных ведомств по статусу «Голоса» и «ENEMO», а также сведения о многочисленных переводах через счета Мельконьянца в рублях и в валюте.