В штрафном изоляторе девушка оказалась из-за споров с силовиками. Сотрудники колонии отобрали у Пономаренко вещи, купленные ею в СИЗО-1 в Барнауле, и не дали ей принять душ. Ей также угрожали запретом на телефонные разговоры с матерью и заставили написать объяснительную во время обеда, заявив, что прием пищи вместо письма будет рассматриваться как отказ от дачи объяснений.
В феврале 2023 года журналистку Марию Пономаренко приговорили к 6 годам лишения свободы по делу о «фейках» об армии. По версии следствия, женщина разместила в своем телеграм-канале ложную информацию о том, что российскими ВКС был нанесен авиаудар по драмтеатру в городе Мариуполь. Провластные российские источники, в том числе и Министерство обороны РФ, эти сведения опровергли.
Новое дело против девушки возбудили после того, как она отказалась идти на дисциплинарную комиссию. Женщина пожаловалась, что у нее нет обуви, после чего сотрудники схватили ее и доставили на комиссию силой. В коридоре она якобы напала на двух сотрудников, которые ее вели.